В публикации «Доисторический период» читаем: «В связи с крестьянской войной под предводительством Е.И. Пугачева (1773-1774 гг.) в смежных с Сибирью губерниях переселение из России временно прервалось. В это время продолжалось переселение внутри ведомства. Появились Меньшиково, Шипицино (1778 г.).
По легенде, которая передается из поколения в поколение мы узнаем историю названия села. Поселился в этих местах богатый купец Парфен Меньшиков. Удобное место для торговли мануфактурой видимо привлекло его, расположенное на берегах живописной реки Изес, богатое полями и пашнями. По фамилии этого купца дали название селу.
До начала 20 в. Село Меньшиково входило в Вознесенскую волость. В начале 20 века образовалась Меньшиковская волость. До 1917 г. входила в Каинский уезд Томской губернии. По сельскохозяйственной переписи 1920 г. Меньшиковская волость ( входило 18 населённых пунктов) относилась к Татарскому уезду Омской губернии. которая была образована в 1919 г.. В августе 1923 г. началось районирование, и в 1924 г. был создан Меньшиковский район, в который вошло 79 населённых пунктов на территории 4,8 тыс. кв. км., населением 25 тыс. человек. Постановлением Западно-Сибирского крайисполкома от 17 января 1931 г. Меньшиковский район был целиком присоединён к Спасскому (Барабинского округа). В том же году образовался Меньшиковский сельсовет.
